服用治療幽門螺桿菌的藥物出現腹瀉，應考慮與藥物有關。治療幽門螺桿菌通常是4種藥物聯合應用，包括一種質子泵抑制劑，兩種消炎藥，以及一種兼有殺滅幽門螺桿菌作用的胃黏膜保護劑，即鉍劑。在很多患者應用鉍劑之后，會出現常見的副作用，即大便顏色發黑、大便次數增多。但不除外在服用幽門螺桿菌的藥物治療期間出現其它原因，導致消化道出血，所以可以進行大便化驗。除此之外，因為相對療程是10-14天，有些患者會比較敏感，比如在服用抗生素之后，可能也會出現大便次數相對增多的情況。因此如果明確沒有既往病因，即目前在服用根除幽門螺桿菌的藥物，又出現腹瀉，應考慮是否與服用的藥物存在相關性。