乙型肝炎的治愈率可能并不高，但通常可得到很大程度的控制。極少數患者確實被治愈部分甚至是自發自愈，在沒有看過醫生的情況下，病毒就全部被完全清除。還可能通過積極的抗病毒藥物治療后，少數患者可完全根除乙肝病毒，但大部分是處在控制的范圍內，使病毒不對機體產生損害的范圍。機體內感染乙肝病毒后，在肝細胞的遺傳物質內進行整合，利用肝細胞材料進行自我復制。體內白細胞若識別到病毒會攻擊肝細胞，在破壞、殺滅病毒的同時肝細胞也被殺滅，從而產生肝功能的損傷。但有時雖然存在病毒，但體內白細胞并未識別也就相安無事。病毒在體內復制較高且具有傳染性，但白細胞不攻擊病毒，肝功能也不會受到損傷。因此對于乙肝的患者，主要通過藥物將病毒的復制降下來，體內乙肝病毒非常低的情況下，既沒有傳染性同時肝功能也不會受到損傷。