呼吸困難最常見的是呼吸系統疾病，但是不能排除其它科的疾病也會引起呼吸困難。如大氣道梗阻、肺氣管或支氣管破壞會引起呼吸困難，還有肺實質結構破壞會引起呼吸困難，或大量胸腔積液、氣胸或膈肌功能障礙會引起呼吸困難。這些需要掛呼吸科，包括阻塞性睡眠呼吸暫停，晚上會出現憋醒的，也要看呼吸科。少部分如心臟科、心衰、心功能不全會引起氣促，重癥肌無力也可以出現呼吸困難。