利福平和利福噴丁屬于同一類抗結核藥物，兩種藥物效果基本相同。利福噴丁是長效制劑，每周使用兩次，胃腸道反應發生比較少，發生肝功能損傷的幾率比利福平少。 一般抗結核治療首選利福平，如果利福平出現肝損傷或者嚴重胃腸道反應可以選用利福噴丁替代，但是結核性腦膜炎病人不能使用利福噴丁，因為利福噴丁不能透過血腦屏障，不能在腦脊液里發揮抗菌作用。