繼發性高血壓包含疾病種類繁多，多數繼發性高血壓疾病可以使用奧美沙坦，但也有少數疾病在嚴重情況下不可使用。對于雙側腎動脈狹窄引起的高血壓患者，以及嚴重腎功能不全、慢性腎臟病、肌酐較高和肌酐清除率較少、血鉀較高的患者，奧美沙坦屬于禁忌藥物。當患者明確診斷后，在不考慮奧美沙坦對化驗分析的影響情況下，除腎上腺功能不全、主動脈縮窄、睡眠呼吸暫停綜合征、輕度腎功能不全、腎炎或腎病綜合征等疾病引起的繼發性高血壓患者之外，奧美沙坦均可使用。對于存在繼發性高血壓但尚未通過化驗檢查明確具體類型的患者而言，建議暫不使用奧美沙坦，否則可能影響檢查時對于內分泌和激素水平功能的判斷。若雙側腎動脈狹窄或嚴重腎功能不全的患者使用奧美沙坦，則可能會導致肌酐和血鉀升高。