在腎囊腫的發生當中要對腎囊腫進行一些鑒別，因為腎囊腫最多見的情況是單純性的囊腫。而單純性的囊腫由于尿鹽的沉積，在囊壁上可以形成局部的鈣化，這是腎囊腫鈣化的由來。但是出現了多發的鈣化，甚至內部有異常的回聲，則需要警惕另外一些疾病，比如囊性腎癌的發生。因此可以將囊腫分為了四級，Ⅰ級往往是最常見的單純性的囊腫，而Ⅳ級毫無疑問可能是囊性腎癌。其中Ⅱ級的腎囊腫內可以出現鈣化，包括一些細小的分隔。Ⅱ級和Ⅲ級相對較難鑒別，尤其是Ⅲ級，其中可能為囊性腎癌的概率為50%。所以出現腎囊腫鈣化的時候，要做進一步詳細的檢查以排查囊性腎癌的發生。如果為囊性腎癌，則治療方案和腎囊腫的治療方案截然不同，往往需要做腹腔鏡下的腎切除手術。