雌激素低可能會造成圍絕經期綜合征的癥狀，使子宮萎縮、外陰萎縮。更年期后，尤其雌激素接近絕經期水平時，外陰的萎縮日漸明顯，其水分減少、彈性變差，可能出現外陰瘙癢癥狀。進入絕經期后因陰道萎縮，陰道的彈性、抵抗力均明顯下降，陰道從正常的酸性轉化為中性，自潔作用消失、陰道炎隨之而來，嚴重的會出現少量出血。 此外可造成盆腔內臟的下垂，因進入絕經期后雌激素水平下降，穩定支持的系統功能退化，以至于盆腔內生殖器官及附近的尿道、膀胱、直腸等下移。女性的腹部也向前松弛膨隆，嚴重者可有子宮脫垂。進入絕經期后雌激素水平下降，可以導致乳房萎縮、使乳房下垂，皮膚變干、變皺、各種色素沉著，毛發變得干枯、灰白，外觀的衰老癥狀日益明顯。 雌激素減少可以使冠心病發病率增高。絕經前女性因卵巢產生的雌性激素，血管不易硬化、血脂不易升高，但進入絕經期后，雌性激素水平急劇下降，心血管病發生率就會有所升高，同時膽固醇和低密度脂蛋白也會顯著增高。此外雌激素減少還會造成骨質疏松。