小兒蛛網膜囊腫通常對智力沒有影響，此病較常見，尤其是顳極蛛網膜囊腫，額部、頂部也會有一些蛛網膜囊腫，可能會引起頭痛，甚至偏癱。但對于認知功能，即使再大的蛛網膜囊腫也不會直接對智力造成影響。 蛛網膜囊腫會引起癲癇，如果沒有得到及時的治療和控制，腦部一直放電會對腦部造成災難性損傷，甚至影響腦的發育。癲癇反復發作之后，認知功能也會受到影響。 總體而言，蛛網膜囊腫本身不會對認知功能造成影響，但并發癲癇后，可能會影響認知功能。