前列腺炎的治療周期往往需要根據前列腺炎的類型來選擇，無癥狀性前列腺炎不需要治療，急性前列腺炎的治療周期主要是根據全身癥狀。如果全身癥狀比較重，需要靜脈應用抗菌素，使用3-5天以后，全身癥狀就可以控制。此后應當繼續口服抗菌素進行治療，治療周期是4-6周，至少2-4周。慢性前列腺炎通常治療周期相對比較長，在抗菌素的選擇上面以口服抗菌素為主，治療周期是4-6周。每2周進行一次療效評價，決定是否繼續應用，或者是停用，或者是更換抗菌素。而其他藥物的治療主要是改善癥狀，如改善排尿癥狀的α受體阻滯劑、M受體阻滯劑，改善疼痛癥狀的非甾體消炎鎮痛藥物，以及非特異性抗炎的植物制劑和中醫藥制劑。對于這一類的藥物治療，周期往往是1-3個月。