做完腸鏡后，通常患者腹部脹氣(即肚子脹氣)時間在24小時左右，隨后可明顯緩解。少部分年老體弱、胃腸道蠕動較慢的患者，還有因洗腸導致短暫性腸道菌群失調的部分患者，可能腹脹時間更久。之所以出現腹部脹氣，是因為腸鏡檢查時通常會往腸道內充入氣體，有利于打開腸腔，以便更好地觀察腸黏膜的情況，明確是否存在病變。充入的介質有空氣或二氧化碳，空氣吸收相對比二氧化碳慢，所以充入空氣的患者腹脹持續時間相對較久。對于部分患者腹脹24小時后仍未明顯緩解，可以適當按摩腹部以促進腸道蠕動，也可以口服益生菌調節腸道菌群，如枯草桿菌二聯活菌、雙歧桿菌三聯活菌等。還可以使用胃動力藥物，如伊托必利，可促進胃腸道蠕動和氣體排出。