陰莖起水泡原因是多方面，所以要針對具體情況進行分析：1、外界摩擦：最常見的就是內褲摩擦。因為有些內褲的材質問題，和陰莖摩擦以后，有的男性就會出磨出水泡來；2、過敏性病變：有些食物或者藥物過敏以后，男性生殖系統會出現皮疹，有的皮疹厲害的時候，就會出現水泡，大多數情況下還會有發癢的感覺；3、病毒感染：皰疹病毒如果感染了陰莖，會表現出有水泡，這些水泡一般集中在龜頭，包皮上有時候也會出現，這時候患者會感覺到疼痛。所以如果患者自身不能找到起水泡的原因，應該到醫院做進一步檢查，來明確病因，進行恰當的治療。