服用鹽酸氟西汀膠囊會影響消化，比如胃脹氣、沒有食欲、惡心、嘔吐、腹痛、反酸燒心等消化不良癥狀，由于并沒有靶向性或選擇性，鹽酸氟西汀膠囊的藥理作用會影響全身器官，因此可能會出現治療目的以外的有害作用，即不良反應。由于鹽酸氟西汀膠囊對食管和胃黏膜有刺激作用，可能會損傷胃黏膜，因此患者可能會出現胃脹氣、沒有食欲、惡心、嘔吐、腹痛、反酸、燒心等消化系統不良反應。出現了以上情況，如果是輕度的影響消化，比如胃脹氣、口干、沒有食欲等，患者可以通過吃乳酶生來幫助消化，緩解癥狀。如果出現了嚴重的消化道不良反應，比如腹痛、反酸燒心、胃潰瘍等癥狀，建議患者立刻停藥并就醫，通過食道鏡或胃鏡等檢查來查看消化道癥狀，在醫生的指導下服用胃黏膜保護劑，比如奧美拉唑或硫糖鋁等藥物，并遵醫囑服用其他抗抑郁藥，比如草酸艾司西酞普蘭片或鹽酸帕羅西汀片，來控制病情。另外，服用鹽酸氟西汀膠囊的患者，在生活上要忌煙、忌酒，規律作息，飲食上不要吃辛辣、刺激的食物，比如辣椒、生洋蔥等，避免加重藥物對胃潰瘍的刺激。