頭孢克肟作為頭孢類抗菌藥物，不應與牛奶、果汁混合后放置服用，以免影響藥物吸收。頭孢克肟作為三代頭孢類抗菌藥物，適用于對頭孢克肟敏感的細菌治療，作為抗菌藥物不應與活菌制劑一起服用，如枯草桿菌二聯活菌以及三聯、四聯活菌制劑，以免對活菌制劑造成影響。頭孢克肟作為頭孢類抗菌藥物，用藥同時應避免飲酒，也不應飲用含酒精的飲料及藥物，如酊劑、酏劑，避免產生雙硫侖樣反應。如中藥藿香正氣水、風濕液內含乙醇，應避免與頭孢克肟同時服用，以免導致體內乙醛蓄積，出現中毒反應，嚴重時可能引起過敏性休克甚至死亡。因此，頭孢克肟需在醫生指導下合理用藥。