16歲男孩陰莖的尺寸接近正常人尺寸，通常正常的尺寸為10-14cm，周徑為5-10cm。正常男孩7歲前，陰莖的長度通常為6cm以下，7-14歲陰莖的長度為6cm以上，14-18歲陰莖的長度為8-14cm。如果16歲，多數男孩陰莖長度為8-10cm，長可以達到14cm，短應該為8cm以上。如果陰莖較短，則說明可能肥胖，陰莖在下腹部的皮下脂肪中，建議減肥。如果16歲男孩陰莖比較小，即幼稚型陰莖，可能是體內缺乏雄激素，應檢查雄激素是否偏低。如果偏低，可以使用激素進行治療。