腦梗針灸治療時間應考慮兩個方面，即每次針灸治療時間和針灸療程時間。針對第一個方面，臨床大約用20-30分鐘，若時間過長會引起肌肉疲勞或穴位刺激度減弱。 在療程方面，應根據患者腦梗部位或癥狀來確定所需療程，比如較輕度皮層部位梗塞，只引起部分肢體功能出現障礙，療程較短。而重要部位如腦干，可影響生命，患者的治療時間相對較長。因此在考慮患者病情同時，應考慮患者梗塞部位，進而確定治療所需時間。