導致孕酮低的原因是內分泌失調、卵巢功能有問題，由于黃體功能不足，進而導致孕酮偏低。懷孕時如果孕酮低，容易造成先兆流產，孕酮過低會使胚胎停止發育。所以在懷孕的時候，如果發生了孕酮偏低，往往會補充一些孕激素，以幫助胎兒發育。在非孕期，如果孕酮偏低，就會出現月經紊亂，往往會表現月經經期的延長或來月經前就有陰道出血，這時候往往會用一些孕激素類藥物來調節月經。還有一種情況，由于孕激素水平偏低，子宮內膜只有雌激素的影響，而使得子宮內膜增厚、過度生長。這時如果發生了子宮內膜的脫落，就會造成大出血，有時還會引起月經淋漓不盡或不止，有的人會出血20多天。如果子宮內膜，由于過度雌激素刺激，而沒有孕激素抵抗，有時內膜還會發生一些病變，所以這時醫生往往會用孕激素來治療、來調節月經。