兒童如果在發熱時出現眼睛痛，常見原因如下：1、全身因素：可能為發熱引起，因發熱常見原因為病毒或者細菌感染引起兒童出現感染性反應，而此種感染毒素可能也會出現全身癥狀，比如眼睛痛、身體不適或者頭部不適等癥狀。此時需要針對兒童原發疾病進行積極控制，比如降低體溫、控制細菌、控制病毒等，可有效緩解發熱、眼痛癥狀；2、局部因素：可能為眼睛本身病變，而發熱可引發兒童出現結膜炎或者眼壓改變造成眼睛痛，此時需要及時到眼科就診，應查明具體眼部疾病為單純結膜炎癥，還是麥粒腫、霰粒腫或眼壓改變等，需要及時控制原發疾病，從而緩解發熱、眼痛癥狀。