在月經的不同期，卵巢的大小各不相同，通常在月經剛結束時卵巢最小，而月經即來潮時卵巢最大。主要與卵巢激素作用于卵巢有關，一般在卵泡生成素的作用下，每個周期當中會有1個卵子發育，卵泡發育并逐漸長大，然后成熟，卵巢也隨之長大，如果排卵以后卵子沒有和精子結合，黃體則會在14天內萎縮。黃體萎縮后會分泌雌孕激素，有時會增長比較大，從而形成黃體囊腫，黃體囊腫的大小通常＜5cm，所以在月經的后半期卵巢比較大。隨著黃體的萎縮，雌孕激素下降，卵巢又恢復到最小水平。如果是生理性增大，在月經后會消失、變小，如果是病理性的囊腫，月經后仍然存在。