治療兒童睡眠肌陣攣，需明確導致其發生睡眠肌陣攣的原因，及時帶孩子到醫院就診，檢查頭部CT或核磁，同時需查24小時腦電圖，觀察其在睡眠過程中發生肌陣攣時，是否有腦電圖異常放電。若存在急性放電，如存在急慢或尖慢波，需要考慮可能由于癲癇引起的兒童睡眠肌陣攣。此時需根據孩子臨床癥狀輕重及發作頻率，考慮是否選擇抗癲癇藥物，若孩子發作頻率較高且癥狀較典型，需要針對性選擇抗癲癇藥物進行治療，同時還需觀察其使用抗癲癇藥物的治療效果及對身體的損傷。若孩子上述檢查均屬于正常水平，考慮可能屬于正常生理現象，因為有部分孩子在睡眠過程中，可能出現肌陣攣現象，主要與其白天精神活動、維生素D與鈣的水平等微量元素水平有一定關系。沒有任何陽性輔助檢查依據的兒童睡眠肌陣攣癥狀，可以不給予藥物治療，對孩子生長發育通常也不會造成影響。