結石急性發作時，患者會有明顯的腎絞痛癥狀，此時急診處理的主要原則是解痙止痛。止痛藥物一般按照三級鎮痛的原則進行選擇，一級鎮痛藥物為非甾體消炎鎮痛藥物，推薦的藥物為雙氯芬酸鈉，雙氯芬酸鈉不僅有鎮痛的效果，而且還能夠減輕輸尿管水腫。二級鎮痛藥物推薦非嗎啡類的中樞鎮痛藥物，常用的藥物是曲馬多，曲馬多鎮痛效果好，而且沒有藥物依賴性。三級鎮痛藥物為嗎啡類中樞鎮痛藥物，常用的藥物是杜冷丁，雖然三級鎮痛藥物的鎮痛效果最強，但也有一定的副作用，通常表現為惡心、嘔吐、呼吸抑制等，一般不適用于年老體弱或者有呼吸系統疾病的患者。除了鎮痛藥物以外，結石痛還可以應用解痙的藥物治療，常用的解痙藥物包括山莨菪堿、黃體酮、鈣離子拮抗劑和α受體阻滯劑，可以舒張輸尿管平滑肌達到解痙，促進結石的排出的效果。如果藥物治療無效，可以急診進行體外碎石治療或者行輸尿管鏡下碎石、置入雙J管二期碎石治療。