奧硝唑氯化鈉與奧硝唑片、替硝唑片及甲硝唑屬于治療厭氧菌感染藥物，作用范圍較窄，需要選擇合適適應癥使用。腹腔感染、胃腸道感染及口腔感染屬于厭氧菌感染可能性較大，采用奧硝唑氯化鈉治療。臨床上用作術前和術后，預防腹腔感染，尤其是腹腔手術。口腔操作后使用奧硝唑預防牙周炎、口腔炎以及口腔厭氧菌感染。皮膚外傷時，如蜂窩織炎、氣性壞疽，奧硝唑氯化鈉用于治療和預防氣性壞疽以及蜂窩織炎。臨床上一種幽門螺旋桿菌，采用阿莫西林、克拉霉素聯合使用，治療幽門螺旋桿菌感染，奧硝唑氯化鈉1天1次即可。