卵巢囊腫分兩類，一類是生理性的瘤樣變，一類是病理性即卵巢囊腫，是良性的腫瘤。但這種良性腫瘤，病因尚不明確。目前為止，卵巢瘤樣變通常是與內分泌功能失調有關，比如瘤樣變中的濾泡囊腫，通常是因為濾泡成熟后，不能排卵造成，最后卵細胞壞死，卵泡內的液體逐漸增多，囊泡達到2cm以上，形成囊腫。黃體囊腫的形成，也與內分泌和女性的激素相關，其病因相對而言，能夠進行分析。對于卵巢的新生腫瘤，即普通囊腫，其病因到目前為止尚不明確，因為病因不明確。所以沒有較好的預防辦法，防止卵巢囊腫發生，只能通過定期查體，出現問題及時的發現及時處理。