目前帕金森病還是主要依賴臨床診斷，但在明確疾病的診斷過程中，可能也需要進行一系列輔助檢查，比如頭核磁檢查。主要是尋找造成帕金森病的癥狀，但不是原發性帕金森病的問題。比如有多系統萎縮可以注意觀察患者是否有十字征、殼核裂隙征等情況，還可以通過對中腦的形態觀察，明確患者是不是進行性核上性麻痹，以及患者是否存在正常顱壓腦積水，這些診斷跟原發帕金森病進行鑒別。對帕金森病檢查有質疑的患者，可以通過核素檢查，比如可以對多巴胺的轉運蛋白等進行檢查，與其他疾病進行鑒別。通過超聲檢查中腦黑質的改變，也有助于支持帕金森病的診斷。此外嗅覺的檢查對于帕金森病的診斷也有一定的幫助作用。