十三價疫苗需要注射四針，通常是在出生后2個月、4個月以及6個月分別注射三針，兒童1歲半后再進行一次加強注射。注射十三價疫苗后，對兒童保護為5年左右。十三價肺炎疫苗只是針對肺炎球菌的十三種莢膜型，有十三個不同小分支，各分支均可侵入體內造成感染，除可以引起肺炎外，還可以引起其他呼吸道感染。進行疫苗注射后，可對十三種莢膜型造成的感染進行預防，但并非注射十三價疫苗后就不會出現肺炎。因為兒童患肺炎，除肺炎球菌的感染外還存在較多原因，呼吸道合胞病毒與腺病毒、支原體、衣原體以及鏈球菌、葡萄球菌等均可導致肺炎。所以十三價肺炎疫苗僅可針對肺炎球菌引起感染，存在預防作用。