核磁共振是影像學重要檢查手段，主要利用人體的原子和質子進行成像，通常對人體沒有射線損害，而CT存在射線損害。除不應用于肺部檢查外，核磁共振可以用于身體任何部位檢查，多用于頭顱和脊髓，可以發現頭顱是否存在腫瘤、脫髓鞘疾病、出血、腦梗死、中耳膜腔出血等脊髓內病變。脫髓鞘病、髓內腫瘤、髓內壓迫、椎間盤壓迫等，都可以通過核磁共振的檢查來進行明確，部分病變還需要使用增強劑進行核磁共振檢查，強化掃描進來明確病變性質。核磁共振檢查在神經科應用較為廣泛，而且對于明確顱內和脊髓內的病變較有幫助。