幽門螺桿菌根除治療是10-14天，多數幽門螺桿菌感染的患者經過10-14天的根除治療之后，能將幽門螺桿菌根除掉。但不除外某些患者因細菌耐藥的問題，一次治療可能難以將細菌根除，可能需要進行第二次根除治療。還有一小部分患者在第一次根除治療后，后期可能出現幽門螺桿菌再感染，雖然概率較低，但也依然存在。幽門螺桿菌根除治療，即四聯療法，需要用4種藥物聯合治療，包括1種質子泵抑制劑、2種消炎藥、1種鉍劑，4種藥物要聯合吃，避免間斷用藥，否則不容易將幽門螺桿菌殺滅，而且容易誘導細菌耐藥。因此藥物治療要規范療程治療，經過10-14天能夠使大部分幽門螺桿菌感染痊愈，患者需要在停藥1個月以后，再次進行幽門螺桿菌檢測，一般會選擇碳13、碳14呼氣試驗方法，檢測幽門螺桿菌是否被根除。