染色體平衡易位因為染色體沒有丟失，所以這種患者是一個攜帶者，其體格和智商沒有影響，但是對生育有一定影響。因為平衡易位的患者，產生正常胚胎的機會是根據其易位的類型不同而不同。像羅氏易位的患者產生正常配子的機會是1/6，另外1/6可能是一個攜帶者的配子，另外4/6是異常的配子。這個異常的配子產生的胚胎，都是以流產告終的，只有正常的配子和攜帶者的配子才會出生。另外是相互易位，產生正常配子的機會是1/18，1/18是攜帶者，另外16/18的配子都是異常的配子，這種異常的配子也會以流產告終。所以平衡易位攜帶者生出正常的孩子的機會比較低，一部分可能是平衡易位的攜帶者，后代生育的時候也會出現生育困難的風險。另外異常的配子流產風險高，平衡易位流產風險＞50%。因此針對平衡易位攜帶者，一般建議進行第三代試管嬰兒，然后做胚胎移植前遺傳學檢查，稱為PGT-SR。篩選正常的胚胎，防止異常胚胎，即懷孕以后流產。