一般沒有特指可以治療甲狀腺球蛋白抗體升高的藥物，有文獻報道，硒酵母有一定的降低甲狀腺球蛋白抗體能力，但實際應用起來，大約有50%的患者有效。應用硒酵母3個月以后，如果甲狀腺球蛋白抗體仍然沒有下降，也不建議患者長期使用。 甲狀腺球蛋白抗體升高多提示機體以甲狀腺為抗原，產生了自身抗體，根據疾病不同，甲狀腺球蛋白抗體升高的程度有所不同。單純的甲狀腺球蛋白抗體、微粒體抗體升高，只是提示機體發生自身免疫性疾病，橋本氏甲狀腺炎、類風濕性關節炎、皮肌炎、系統性紅斑狼瘡、Still病時，都可發生甲狀腺球蛋白抗體升高。在橋本氏甲狀腺炎時，如果只是甲狀腺球蛋白抗體升高，一般不需要特殊治療。當發生甲狀腺功能減退癥時，給予左甲狀腺激素替代治療。單純只是甲狀腺球蛋白抗體升高，建議3個月或半年進行復查。同時檢查甲狀腺功能，如果出現甲狀腺功能減退癥，給予替代治療，但是對于抗體升高目前并沒有特異性藥物。