第三針人乳頭瘤病毒(HPV)疫苗最疼的情況應該不會出現，每一針HPV疫苗的注射量、位置類似，患者注射時的痛感應該也類似。如果出現第三針時最痛的情況，也可能是與不同醫務工作者的操作手法有一定關系，而不是必然出現的情況。患者注射HPV疫苗后，還需注意注射部位，以防止感染，注意注射的手臂是否存在疼痛感，注意患者自己是否存在發燒、低燒等情況。如果患者希望懷孕，最好選擇注射HPV疫苗后，3個月后再懷孕才較安全。此時可使患者的身體整個免疫系統，充分發揮出免疫作用。雖然患者注射HPV疫苗，相對更安全，但HPV病毒種類非常繁多，九價疫苗中只預防4種高危性HPV類型。患者每年一次的液基薄層細胞檢測(TCT)和HPV檢查必不可少，不能因為注射HPV疫苗便覺得不用進行該檢查，注射HPV與預防宮頸病變不等量，只是患者將最危險的病毒良好避免。但引起宮頸病變的病毒，不僅是HPV病毒，還有其他如巨細胞病毒、單純皰疹病毒，也有導致宮頸病變的作用。