用核素碘-131治療甲狀腺疾病以后，最大的副作用就是造成甲狀腺功能減退癥。核素碘-131治療甲狀腺的某些疾病，包括彌漫性甲狀腺腫伴甲狀腺功能亢進癥、某些甲狀腺結節、甲狀腺癌，患者不愿意進行藥物治療或者手術治療，均可以采用核素碘-131治療。碘-131治療屬于靶向性治療、精準治療，治愈率高，復發率低，是患者常選用的方式之一。碘-131的β射線射程短，對甲狀腺以外的組織一般沒有太大傷害。而碘主要聚集在甲狀腺內，其他組織對碘沒有聚集的能力。所以使用的放射性核素碘大部分都聚集在甲狀腺，而且放射線又比較短，對甲狀腺以外的組織沒有造成一些傷害。使用碘-131治療甲狀腺疾病以后，一般最常見的副作用是產生甲狀腺功能減退癥。這是由于在使用的過程中，如果量少，原發疾病沒有控制，使用的量稍微多一點，就容易發生甲狀腺功能減退癥，這個在臨床上是認可的，可以用左甲狀腺激素替代治療。