歸脾丸的主要作用是健脾益氣、養血安神，因此，可以用來治療心脾兩虛造成的月經不調。這類患者通常會有月經延遲或月經提前、月經量少或月經顏色淡，同時可能有心煩、失眠癥狀。但臨床上的月經不調涉及范圍本身非常廣泛，病因也十分復雜，不見得所有的月經不調都可以用歸脾丸來治療。有些患者由于精神過分緊張、壓力過大造成了月經不調，屬于中醫學中肝氣郁結的范疇，這類月經不調使用逍遙丸，或加味逍遙丸的效果會更為明顯，而歸脾丸達不到很明顯的治療作用。瘀血內阻型的月經不調，同樣歸脾丸也不是很好的選擇，更加推薦使用桂枝茯苓膠囊或益母草顆粒。