通過超聲心動圖可以檢查出很多疾患，大致分為先天性心臟病、心臟瓣膜病、風濕性心臟病、心肌病、心包疾病、肥厚型心肌病、擴張型心肌病、限制性心肌病、心臟腫瘤、血栓、冠狀動脈疾病，大血管的疾病比如心包的積液、心肌病、先天性心臟病、各種心臟瓣膜病、急性心肌梗死的并發癥，比如室間隔的穿孔、乳頭肌的斷裂、室壁瘤、假性室壁瘤、高血壓并發癥、心肌炎的嚴重程度，心腔內的附壁血栓形成等，具有重要的診斷價值。 對于心臟腫瘤、冠心病、心包疾病、高血壓性心臟病、肺心病、人工瓣膜隨訪、大血管疾患也有輔助診斷的價值。 對確定血栓來源，尤其是對于經胸超聲不能獲得的滿意圖像及左心耳內部的血栓，感染性的心肌炎、主動脈的夾層、術中的監測等具有重要作用。 此外，超聲心動圖在很多疾病的治療中也提供相應的有效信息，從而幫助治療。