引起甲狀腺功能減退的病因非常多樣，甲狀腺是人體最大的內分泌腺體，它就像一個工廠，生產的原料是碘元素。如果碘元素缺乏原料不夠，甲狀腺功能就會減退。比如地方性的甲狀腺腫就是當地環境當中碘缺乏引起，甲狀腺合成甲狀腺激素的能力下降。還可以出現腦垂體進一步代償性分泌促甲狀腺激素，讓甲狀腺提高生產能力。但是碘缺乏也可以造成甲狀腺功能減退、地方性甲狀腺腫，通過食鹽加碘，以及食物當中增加碘的攝入，能夠有效地預防和治療碘缺乏性疾病。但是引起甲狀腺功能減退的病因非常多，比如甲狀腺工廠被破壞。其中手術切除或者是自身免疫性的炎癥，最常見的甲狀腺自身免疫性炎癥叫慢性淋巴細胞性甲狀腺炎，也叫橋本甲狀腺炎，以及甲狀腺放射性治療，可以造成甲狀腺工廠被破壞。因此如果是碘元素缺乏，僅僅是造成甲狀腺功能減退的少見病因之一。而其他最常見的甲狀腺功能減退的病因，包括手術切除、碘-131治療和甲狀腺自身免疫性損傷。