九價HPV疫苗涵蓋高危亞型的HPV種類更多，預防宮頸癌以及癌變幾率更大。但并非在注射九價宮頸癌HPV疫苗后，能預防所有宮頸癌變的發生，所以注射結束后仍需定期進行宮頸癌篩查。注射九價HPV疫苗，僅能預防多數高危亞型人乳頭瘤病毒感染所導致的宮頸癌，即可預防90%左右的宮頸癌發生。而且因為疫苗截止到目前為止研發的時間較短，遠期保護效力能夠持續時間尚不明確。因此需注射九價疫苗后的女性按時進行宮頸癌檢查，如液基細胞學檢查、高危亞型人乳頭瘤病毒檢測。必要時需進行陰道鏡下宮頸活檢，才能最終明確是否有癌前病變及癌變。此外，九價HPV疫苗預防低危亞型，僅是HPV6和HPV11兩種亞型，且只能預防多數尖銳濕疣的發生，但是并不能保證在未來患尖銳濕疣。所以注射九價疫苗后平時健康體檢、宮頸癌篩查，以及未來關于性行為的保護，與未注射HPV疫苗的女性應同等看待。