免疫熒光檢查的用途較廣泛，既可以檢查病毒，也可以檢查微生物，還可以檢查細菌。在病理檢查中運用最多的是FISH檢測方法，通常每一個乳腺癌病人均會進行HER-2檢測。如果HER-2表達是陰性，病人不能夠從赫賽汀治療中獲益。如果HER-2表達為(+++)，病人可從赫賽汀治療中獲益。 但是還有一種狀態，即在免疫組化表達中是(++)，此種情況下就會運用到FISH檢測方法明確HER-2狀態。部分(++)的病人通過FISH檢測方法可檢測到HER-2擴增，可以從赫賽汀的治療中獲益。如果是陰性，病人不能夠運用赫賽汀進行治療。 當然，FISH檢測不僅運用在乳腺癌中，在其他腫瘤中均會運用。比如淋巴瘤也可以運用FISH檢測方法，明確是不是一種侵襲性極強的病變。