液氮冷凍原理是組織熱量大量釋放以后，造成組織的結晶水腫、壞死，這個過程因為會出現水腫、壞死，所以會形成炎癥反應刺激神經末梢，出現疼痛。液氮冷凍時可以達到-196℃左右，低溫時與皮膚接觸，皮膚自然感覺劇烈疼痛，類似手在冰箱里拿冰塊時間過長會感覺冰冷刺骨，所以開始凍的疼痛是冰冷、刺骨疼痛的感覺。 炎癥反應時，出現水腫、壞死、血泡，這時的疼痛是因為炎癥刺激，形成血泡以后因為張力刺激也會形成疼痛反應。一般液氮冷凍以后出現輕微疼痛正常，回訪患者時若治療以后沒有任何反應說明不夠，但疼痛劇烈，出現血說明治療過量。