HPV39型陽性可能會通過性生活傳染，而不是通過日常的生活方式、生活接觸傳染。所以女性如果感染了HPV39型，這種類型的HPV病毒不用擔心因為生活中的接觸而傳染給別人。一般當男性生殖器攜帶有HPV病毒，如HPV39型病毒時，可能會在性生活女性機體抵抗力下降，并且出現陰道黏膜局部破損的情況下，導致女性感染HPV病毒。女性感染HPV病毒以后，絕大多數都會通過自身免疫力將病毒自行清除。所以大多數女性感染病毒以后沒有任何臨床癥狀，也不會導致臨床疾病。一般在8-12個月病毒會自行清除，自行轉陰。但是仍然有少部分女性會出現HPV39型陽性持續性感染。如果出現HPV病毒持續感染，就有可能會引起女性宮頸癌和宮頸上皮內病變，或引起女性生殖道尖銳濕疣，這種情況需要密切隨訪觀察，并且給予相應的隨訪處理。