吃四聯藥物有一定的副作用，根據藥物種類不同，副作用不同，具體如下：1、抗生素：抗生素多數有胃腸道反應，相對而言，阿莫西林的胃腸道反應少，副作用小，兒童也可應用。克拉霉素的不良反應是特別苦，部分病人吃完藥很長時間后，依然有口腔很苦的異常感受。喹諾酮類藥物可影響骨骺愈合，即骨骺過早閉合，14歲以下的青少年不給予用藥。呋喃唑酮的副作用是胃腸道反應較明顯，比如腹痛、腹瀉等，這是消炎藥；2、鉍劑：主要的副作用為病人的舌頭、大便均染黑，可引起大便性狀改變，停藥一段時間后自行緩解；3、質子泵抑制劑：應用時間較長時，可出現菌群失調，如腸易激綜合征等感染性風險。另外，可影響維生素B12等營養素的吸收，長期反復應用，可引起食管癌、胃癌的發病風險增高。應注意不濫用藥物，需遵醫囑，嚴格控制藥物的使用。