碘伏可以應用于傷口，即便是黏膜和開放性傷口，也可應用碘伏直接涂抹，不會對傷口的愈合和患者的本身造成不適，或導致愈合不良的情況出現。在臨床工作中，碘伏是目前應用比較廣泛的消毒制劑，其具有可靠的殺滅細菌、病毒的作用，同時由于是絡合物，不會對腸道、黏膜、組織產生明顯的刺激和損傷，應用碘伏患者也不會產生明顯疼痛等。在應用碘伏時，即便是腸道手術，也可以將碘伏直接涂抹在腸道切口處，不會對腸道的吻合產生任何不利影響，因此碘伏可以應用在傷口內。有時醫生會將碘伏進行適當的稀釋，用于傷口的沖洗和腹腔的沖洗，此操作主要是為了減少腸道表面對碘伏的不適反應，而減少腸道粘連，因此碘伏可放心使用，不像酒精只能應用于皮膚完整的傷口表面，尤其是在手術消毒時，才可以應用酒精類消毒制劑。