口腔潰瘍反復發作可能是由于全身系統性疾病，以及全身基礎性疾病引起，此時應在保持口腔清潔衛生的基礎上，盡量聯合其他科室的醫生，進行綜合分析與檢查，從而給予較好的治療。口腔潰瘍反復發作的患者，進行綜合治療是最好的。對于口腔潰瘍反復發作的患者，單純治療口腔潰瘍可能無法根治疾病。首先應由口腔科醫生進行仔細檢查，進行對癥支持治療，同時需保證患者的內分泌系統，以及全身的系統處于較好的狀態。還需囑患者注意飲食，避免攝入辛辣的食物。應注意休息，以避免勞累而導致口腔潰瘍反復發作。患者需盡量提高免疫力，增強體質，也可避免反復發作的情況出現。