肛裂自行愈合的情況可能會發生，但并不是自然而然的發生。如果發生肛瘺以后沒有改變飲食習慣和排便習慣，大便仍然非常干結，其不會自愈。如果發生肛裂以后積極改變大便和飲食習慣，多吃粗纖維蔬菜，多喝水，養成定時排便的習慣，或者讓大便保持軟便或者稀便狀態，不再加重肛裂的程度，肛裂有可能自愈，但這種幾率比較小。 多數肛裂由于不注意會形成慢性肛裂，慢性肛裂很難自愈，往往需要借助手術處理。手術處理的重點是切除慢性潰瘍面，即肛裂創面，需要解決疼痛的問題。疼痛是內括約肌的攣縮痛，因此需要將內括約肌進行一部分離斷，并且需要進行充分的擴張，而擴張的目的是增加糞便的排出口徑，以減少和預防以后肛裂的再次發生。