腫瘤三項不是診斷癌癥的唯一指標。因為目前所有腫瘤標志物都不具有特異性，準確率達不到100%，部分癌癥患者從確診到死亡，整個病程中腫瘤標志物可能不增高。 部分患者如果有炎癥、感染，或受到藥物、酒精等刺激，腫瘤標志物也可能會有輕度升高。因此腫瘤三項不一定能查出癌癥，需要結合其它檢查，如影像學檢查、病理學檢查、內鏡檢查進行診斷，其中病理學檢查為診斷的金標準。