甲硝唑片口服制劑任何時期均可服用，月經期也可服用，若是陰道用甲硝唑栓劑，通常建議患者在月經基本干凈后再在陰道用藥。因為通常甲硝唑栓劑用來治療外陰炎癥，療程有一定要求，可能需要至少連續使用1周，若月經還未干凈時使用，可能會對陰道內環境造成一定影響。月經后期可能部分患者抵抗力較薄弱，若每天用藥可能造成外源性感染，導致陰道炎癥加重。通常在還有經血的情況下，不太建議患者使用栓劑，陰道出血基本干凈或干凈1-2天時就可開始使用甲硝唑栓劑，原則為每天使用1顆，連續使用7天左右，通常7天使用完后隔2-3天再到醫院進一步檢查及診治。