腹瀉以后肛門疼痛，原因通常包括排便刺激、肛周皮膚病變，具體如下：1、排便刺激：如果出現頻繁腹瀉，糞便需要經過肛門排出，可能反復刺激肛門，導致肛門疼痛；2、肛周皮膚病變：由于腹瀉時，稀便黏液可能存在毒素，如果刺激到肛門周圍的皮膚，導致濕疹或者皮炎，亦可引起肛門疼痛。如果存在長期腹瀉，需要針對腹瀉進行治療。如果腹瀉暫時無法治愈，也需要檢查肛門周圍皮膚，有無潰爛、皮炎、濕疹等。如果存在皮膚病變，需要針對皮膚疾病進行及時治療，例如發生濕疹可以外用藥膏，發生皮炎應該及時造口、進行皮膚護理等，通常可以減輕肛門疼痛。