低級別上皮內瘤變指細胞瘤變的級別很低，而高級別瘤變與腫瘤、癌癥更接近，所以臨床一旦發現上皮內瘤變，不管是低級別瘤變還是高級別瘤變，都要及時給予處理。主要治療手段是手術切除，如果局限在黏膜類，可在胃內鏡下面進行黏膜剝離術。 如果位置比較深、黏膜剝離不掉要進行手術切除，可開腹或者腔鏡下治療。最關鍵的是對于上皮內瘤變要及早發現、早期診斷、早期治療、早期治愈，以防止進一步惡化變成癌癥。