肛周膿腫的手術種類很多，根據膿腫部位以及嚴重程度決定手術方式。對于表淺膿腫，范圍較小，或涉及到肌間隙，且情況并不復雜，這種手術是小手術。完全是通過切開引流，能使膿腫得到快速愈合。 對于位置比較高，涉及間隙比較多，而且范圍比較廣，比較復雜的膿腫，如肛提肌以上的的膿腫，或者坐骨直腸窩的深部膿腫，或直腸黏膜下較高位的膿腫，這種膿腫外部表現不典型，但早期會發生中毒癥狀。此時做手術，其相對是大手術，此類手術損傷大且需要掛線，恢復時間也較長。所以肛周膿腫手術的大小只能根據病情做相應的考慮。