慢性咽炎可以通過間接的喉鏡檢查，觀察咽喉部是否有黏膜充血或者新生物。還可以做電子喉鏡檢查，把鏡子伸入咽喉深部，更加仔細和清晰地觀察咽喉部的病變。建議部分人群進行電子鼻咽鏡檢查，因為慢性咽喉炎由于慢性鼻竇炎刺激，鼻涕可能不多，順著后鼻孔流到咽喉部，刺激咽喉部產生慢性炎癥。所以最好進行電子鼻咽鏡境檢查，或者鼻竇CT，觀察鼻竇和鼻腔，是否有病變，或者炎癥。對于咽喉部明顯燒灼感的患者，建議進行胃鏡或者食管鏡檢查。因為這類患者大部分伴有食管反流，所以要看胃部和食管，有沒有炎癥。這類患者最好再進行頸部的CT檢查，排除頸部的隱匿性病變，使診斷更加確切。