眼睛疼、頭疼的原因比較復雜，應該及時就診，可能要在眼科、神經科等諸多科室專家指導下，進行必要檢查，做出鑒別診斷，采取對因治療。具體原因如下：1、角膜炎：眼睛局部病變刺激三叉神經，引起三叉神經痛，所以眼睛疼的同時三叉神經疼引起頭疼，以頭前部為主，還可以有流眼淚等其他體征；2、青光眼：導致眼壓高，引起眼睛疼、頭疼；3、高血壓：在高血壓、動脈硬化的基礎上，造成頭疼、眼睛發脹、眼睛疼；4、顱內壓改變：顱壓高造成頭疼、眼睛發脹、眼睛疼。