甲狀腺功能亢進的內科治療藥物，主要包括丙硫氧嘧啶和甲巰咪唑，這兩種藥物有各自的特點。丙硫氧嘧啶起效相對快，對胎兒和嬰幼兒的影響相對較小，因此在妊娠和哺乳狀態下可以服用。甲巰咪唑起效相對慢，但是對肝功能影響更小，效力維持時間更長久。但是丙硫氧嘧啶和甲巰咪唑均有共同的副作用，包括過敏、起皮疹、肝功能損害，因此甲狀腺功能亢進的藥物治療，要在醫生監測下才可以進行。藥物內科治療是甲狀腺功能亢進治療的首選方案，優先于碘-131治療和手術治療，畢竟內科藥物治療副作用相對更小、效果更穩定。