黃連上清片、牛黃上清片的主要區別為組成的藥物不同，功效、主治無較大區別。黃連上清片的主要組成藥物有黃連、黃芩、黃柏、梔子、大黃、桔梗、白芷、防風、蔓荊子、石膏等。牛黃上清片主要由人工牛黃、黃芩、黃連、黃柏、梔子、大黃、石膏、薄荷、菊花等藥物組成。黃連上清片具有散風清熱、解毒止痛的作用，牛黃上清片具有清熱解毒、瀉火止痛的作用，兩者的功效較相近；黃連上清片和牛黃上清片，均可以治療中上焦風熱所引起的一系列癥狀，比如面紅目赤、口舌生瘡、口腔潰瘍、牙齦腫痛、咽喉疼痛、小便短赤、大便閉結等。